在长岛，废弃的化粪池系统造成的氮污染导致藻类大量繁殖和赤潮。© USCG

总氮是硝酸盐氮、亚硝酸盐氮、氨氮和有机氮的总和。它是植物体内维生素和能量系统的组成部分，也是叶绿素、每个活细胞的重要组成部分，如果一旦出现缺氮元素的情况，细胞的合成会受到阻碍，植物的生长也会停止。

氮可以帮助植物生长，但太多的“好事”会变“坏事”。水中的总氮含量是衡量水质的重要指标之一，高浓度的氮素会引起水体富营养化。当过多的氮流入海湾时，生长迅速的植物就会与生长较慢的有益植物竞争并杀死它们。腐烂的植物会消耗氧气，导致鱼类和其他海洋生物死亡。藻类暴发，如褐潮、锈潮和被称为Ulva（又名海莴苣）的大型藻类，就是我们在美国纽约长岛周围看到的例子。

赤潮藻类亚历山大藻产生一种强大的神经毒素，这种神经毒素积聚在滤食性贝类中，会毒害食用它们的人或野生动物。有毒藻类越来越多地出现在长岛的海湾和港口。

长岛的池塘和湖泊也受到氮污染的影响。除了助长入侵植物（如水盾草）的侵染外，高氮含量还增加了“杀手”蓝绿藻的生长和毒性。蓝绿藻对鱼类、野生动物、牲畜、宠物和人类有毒。2015年，考虑到这一威胁，萨福克县（Suffolk County）对14个湖泊和池塘发布了“禁止接触”的警告。